MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002679	ATCC	2	8	69924	69931	25 %	25 %	0 %	50 %	13488213
1002	NC_002679	CGG	2	6	69955	69960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488213
1003	NC_002679	TGA	2	6	70020	70025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488213
1004	NC_002679	GAAC	2	8	70037	70044	50 %	0 %	25 %	25 %	13488213
1005	NC_002679	CGGC	2	8	70060	70067	0 %	0 %	50 %	50 %	13488213
1006	NC_002679	GCC	2	6	70138	70143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488213
1007	NC_002679	CGA	2	6	70191	70196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488213
1008	NC_002679	GCT	2	6	70206	70211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488213
1009	NC_002679	CGG	2	6	70227	70232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488213
1010	NC_002679	CGT	2	6	70252	70257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488213
1011	NC_002679	GTC	2	6	70326	70331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488213
1012	NC_002679	CCG	2	6	70355	70360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488213
1013	NC_002679	CTG	2	6	70392	70397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488213
1014	NC_002679	GCC	2	6	70435	70440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488213
1015	NC_002679	CAC	2	6	70494	70499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488213
1016	NC_002679	TGC	2	6	70580	70585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488213
1017	NC_002679	GCG	2	6	71143	71148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488062
1018	NC_002679	TTTC	2	8	71256	71263	0 %	75 %	0 %	25 %	13488062
1019	NC_002679	GAT	2	6	71277	71282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488062
1020	NC_002679	CTT	2	6	71301	71306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488062
1021	NC_002679	ACC	2	6	71329	71334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488062
1022	NC_002679	GCCG	2	8	71355	71362	0 %	0 %	50 %	50 %	13488062
1023	NC_002679	TG	3	6	71376	71381	0 %	50 %	50 %	0 %	13488062
1024	NC_002679	CAGGG	2	10	71394	71403	20 %	0 %	60 %	20 %	13488062
1025	NC_002679	TTG	2	6	71425	71430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488062
1026	NC_002679	GAC	2	6	71445	71450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488062
1027	NC_002679	CGG	2	6	71453	71458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488062
1028	NC_002679	TGT	3	9	71480	71488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488062
1029	NC_002679	CTT	2	6	71492	71497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488062
1030	NC_002679	GGC	2	6	72124	72129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488063
1031	NC_002679	ATG	2	6	72226	72231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488063
1032	NC_002679	GTC	2	6	72232	72237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1033	NC_002679	GTC	2	6	72392	72397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1034	NC_002679	CTT	2	6	72457	72462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488063
1035	NC_002679	GCA	2	6	72503	72508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1036	NC_002679	CGA	3	9	72528	72536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1037	NC_002679	TTC	2	6	72553	72558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488063
1038	NC_002679	CGGC	2	8	72596	72603	0 %	0 %	50 %	50 %	13488063
1039	NC_002679	GTC	2	6	72610	72615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1040	NC_002679	GAT	2	6	72646	72651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488063
1041	NC_002679	CGG	2	6	72672	72677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488063
1042	NC_002679	ACG	2	6	72701	72706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1043	NC_002679	CCA	2	6	72707	72712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488063
1044	NC_002679	GCA	2	6	72735	72740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1045	NC_002679	CGC	2	6	72750	72755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488063
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1047	NC_002679	CGC	2	6	72765	72770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488063
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1049	NC_002679	GGC	2	6	72819	72824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488063
1050	NC_002679	AGC	2	6	72848	72853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1051	NC_002679	GCC	2	6	72859	72864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488063
1052	NC_002679	TCG	2	6	72869	72874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1053	NC_002679	AGC	2	6	72914	72919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1054	NC_002679	TCCGGA	2	12	72932	72943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13488063
1055	NC_002679	CCTTGA	2	12	73011	73022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13488063
1056	NC_002679	CGG	3	9	73050	73058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488063
1057	NC_002679	TGG	2	6	73068	73073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488063
1058	NC_002679	GCCGGC	2	12	73111	73122	0 %	0 %	50 %	50 %	13488063
1059	NC_002679	GCT	2	6	73540	73545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488329
1060	NC_002679	A	6	6	73547	73552	100 %	0 %	0 %	0 %	13488329
1061	NC_002679	CGA	2	6	73563	73568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488329
1062	NC_002679	TTG	2	6	73573	73578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488329
1063	NC_002679	GCC	2	6	73602	73607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488329
1064	NC_002679	GTC	2	6	73637	73642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488329
1065	NC_002679	CATC	2	8	73649	73656	25 %	25 %	0 %	50 %	13488329
1066	NC_002679	CGG	2	6	74240	74245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488349
1067	NC_002679	TGC	2	6	74276	74281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488349
1068	NC_002679	GGCC	2	8	74294	74301	0 %	0 %	50 %	50 %	13488349
1069	NC_002679	GAT	2	6	74310	74315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488349
1070	NC_002679	GAC	2	6	74341	74346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488349
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1072	NC_002679	GTC	2	6	74395	74400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488349
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1074	NC_002679	GCC	2	6	74445	74450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488349
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1080	NC_002679	CGA	3	9	75206	75214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488065
1081	NC_002679	GCC	2	6	75219	75224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488065
1082	NC_002679	AGA	2	6	75250	75255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488065
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1085	NC_002679	CGG	2	6	75320	75325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488065
1086	NC_002679	CGAT	2	8	75433	75440	25 %	25 %	25 %	25 %	13488065
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1088	NC_002679	TCA	2	6	75491	75496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488065
1089	NC_002679	CGAGGT	2	12	75554	75565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13488065
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1091	NC_002679	GCTC	2	8	75724	75731	0 %	25 %	25 %	50 %	13488065
1092	NC_002679	GCG	2	6	75744	75749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488065
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1095	NC_002679	GGC	2	6	75910	75915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488065
1096	NC_002679	GGT	2	6	75920	75925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488065
1097	NC_002679	GCAA	2	8	75940	75947	50 %	0 %	25 %	25 %	13488065
1098	NC_002679	CAG	2	6	75948	75953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488065
1099	NC_002679	CGAA	2	8	76053	76060	50 %	0 %	25 %	25 %	13488065
1100	NC_002679	CGC	2	6	76069	76074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488065
1101	NC_002679	ATG	2	6	76143	76148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488065
1102	NC_002679	CGA	2	6	76167	76172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488065
1103	NC_002679	CGG	2	6	76201	76206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488066
1104	NC_002679	CCT	2	6	76207	76212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488066
1105	NC_002679	TCG	2	6	76239	76244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488066
1106	NC_002679	GGC	2	6	76260	76265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488066
1107	NC_002679	A	6	6	76317	76322	100 %	0 %	0 %	0 %	13488066
1108	NC_002679	GC	3	6	76323	76328	0 %	0 %	50 %	50 %	13488066
1109	NC_002679	CGG	2	6	76357	76362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488066
1110	NC_002679	CGG	2	6	76447	76452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488066
1111	NC_002679	CGC	2	6	76469	76474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488066
1112	NC_002679	TGC	2	6	76523	76528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488066
1113	NC_002679	TCT	2	6	76576	76581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488066
1114	NC_002679	AAT	2	6	76594	76599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488066
1115	NC_002679	GCC	2	6	76649	76654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488066
1116	NC_002679	TCA	2	6	76741	76746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488066
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1119	NC_002679	CGA	2	6	76855	76860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488066
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1121	NC_002679	CGG	2	6	76927	76932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488066
1122	NC_002679	GGC	2	6	76976	76981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488066
1123	NC_002679	AC	3	6	76987	76992	50 %	0 %	0 %	50 %	13488066
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